Qualitas führt für Braunvieh Schweiz, den Schweizerischen Holsteinzuchtverband und swissherdbook die Zuchtwertschätzungen durch. In drei Routineauswertungen (März/April, Juli/August und November/Dezember) werden neue Zuchtwerte für die Milchleistungsmerkmale (inkl. Persistenz und Zellzahl), die Lineare Beschreibung und Einstufung (LBE),  die Nutzungsdauer, die Melkbarkeit, die weibliche Fruchtbarkeit sowie für den Geburtsablauf geschätzt.

Qualitas schätzt für den Schweizerischen Ziegenzuchtverband für die Hauptrassen Saanenziege, Toggenburgerziege und Gämsfarbige Gebirgsziege, für den Schweizerischen Eringerzuchtverband  und für die Schweizerische Milchschafzuchtgenossenschaft Zuchtwerte für die Milchleistungsmerkmale.